Program strata satu (S-1)/sarjana yang diselenggarakan oleh Universitas Mikroskil mencakup:
Program S1 Teknik Informatika dan Sistem Informasi memiliki beban kredit 144 s.d. 150 SKS yang dijadwalkan selesai dalam 8 semester. Lulusan program S1 Teknik Informatika dan Sistem Informasi berhak menggunakan gelar Sarjana Komputer (S.Kom.) sesuai ketentuan yang berlaku.
Program S1 Manajemen dan Akuntansi memiliki beban kredit 144 s.d. 150 SKS yang dijadwalkan selesai dalam 8 semester. Lulusan program S1 Manajemen dan Akuntansi berhak menggunakan gelar Sarjana Ekonomi (S.E.) sesuai ketentuan yang berlaku.